Figlio di un architetto, Christie è cresciuto in una famiglia americana che, da amante delle arti, trascorreva lunghi periodi in Europa. Dopo i primi studi e le prime esperienze musicali, intraprende lo studio della storia dell'arte all'Università di Harvard, dove si laurea nel 1966. Successivamente riprende lo studio del clavicembalo all'Università Yale, sotto la guida di Ralph Kirkpatrick e Kenneth Gilbert.
Rapidamente si fa apprezzare come interprete di musica antica, acquistando la fama di specialista del barocco francese con la pubblicazione dei suoi primi dischi.
Nel 1979 fonda Les Arts Florissants, gruppo vocale e strumentale ad organico variabile votato all'interpretazione della musica antica. Christie, che tuttora dirige Les Arts Florissants, ha condensato nell'ormai quarantennale attività del gruppo la sua ricerca musicologica nell'ambito della musica antica, specialmente su compositori francesi come Lully, Rameau e Charpentier (dalla cui opera omonima ha mutuato il nome) e molti altri meno conosciuti. Tra gli autori non francesi affrontati spesso con Les Arts Florissants troviamo Henry Purcell, George Frideric Handel, Wolfgang Amadeus Mozart e Claudio Monteverdi. Grazie all'attività di Christie è stato possibile riscoprire molteplici capolavori dimenticati nel tempo, molti dei quali sono lavori di ampio respiro.
Professore al Conservatoire national supérieur de musique et de danse de Paris dal 1982 al 1995, dove ancora svolge attività didattica, dal 2007 William Christie tiene seminari sulla prassi storicamente informata anche alla Juilliard School. Dal 2002 dirige, con Kenneth Weiss e Paul Agnew, Le Jardin des Voix, un'accademia a Caen per la formazione di giovani cantanti per l'esecuzione di opere del periodo barocco. Gli allievi, successivamente, vengono spesso invitati a collaborare ai progetti di Les Arts Florissants; tra di loro troviamo Sonya Yoncheva, Christophe Dumaux, Emmanuelle de Negri, Marc Mauillon, Amel Brahim-Djelloul, Lea Desandre e Eva Zaïcik.
1980 – Charpentier: Deux Oratorios (Harmonia Mundi)
1980 – EtienneMoulinié: Cantique de Moÿse (Harmonia Mundi)
1981 – Charpentier: Pastorale (Harmonia Mundi)
1990 – C. P. E. Bach: The Israelites in the Desert - William Christie/Cappella Coloniensis/Corona Coloniensis/Barbara Schlick/Hein Meens/Lena Lootens/Stephen Varcoe(Harmonia Mundi)
2005 – Charpentier: Te Deum - Grand Office des Morts - Les Arts Florissants/William Christie, (EMI/Virgin/Erato)
2004 – Haendel: Serse - Les Arts Florissants/William Christie/Anne Sofie von Otter, (Erato/Warner)
2006 – Charpentier: Judicium Salomonis - Les Arts Florissants/William Christie, (EMI/Virgin/Erato)
2006 – Le Jardin des Voix - Les Arts Florissants/William Christie, (EMI/Erato)
2007 – Haydn: Die Schöpfung - Les Arts Florissants/William Christie, (EMI/Virgin/Erato)
2007 – Purcell: Divine Hymns - William Christie, (EMI/Virgin/Erato)
2007 – Haendel, Arie - De Niese/Christie/Arts Flor., (Decca)
2008 – Haendel Edition, Vol. 1: Alcina & Orlando - Les Arts Florissants/William Christie, (Warner)
2008 – Haendel Edition, Vol. 8: Acis and Galatea, Theodora, Agrippina Condotta a Morire, Armida Abbandonata & la Lucrezia - Giovanni Antonini/Il Giardino Armonico/Les Arts Florissants/William Christie, (Warner)
2008 – Otter, Ombre de mon amant (Arie barocche francesi) - Christie/Les Arts Florissants, (Archiv Produktion)
2009 – Campra & Couperin: Motets - William Christie/Les Arts Florissants, (Erato/Warner)
2009 – Purcell Edition, Vol. 1: Dido & Aeneas, King Arthur & the Fairy Queen - Concentus Musicus Wien/Les Arts Florissants/Nikolaus Harnoncourt/William Christie, (Warner)
2009 – 30th Anniversary - Les Arts Florissants Compilation - Les Arts Florissants/Les Arts Florissants Chorus/William Christie, (Warner/Erato)
2011 – Duetti - Les Arts Florissants/Max Emanuel Cencic/William Christie, (EMI/Virgin/Erato)
Nel 2006 i "Jardins du Bâtiment", il sontuoso giardino che Christie ha progettato e realizzato per la sua villa a Thiré, hanno ottenuto il riconoscimento di "monumento di interesse storico". Dal 2012 Christie ha dato vita al festival estivo di musica antica "Rencontres Musicales: Dans les Jardins de William Christie", che si svolge nella sua tenuta.
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