BLAST

De Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is een algoritme dat gebruikt wordt voor het vergelijken (aligneren) van een DNA- of eiwit-sequentie in verscheiden…

De Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is een algoritme dat gebruikt wordt voor het vergelijken (aligneren) van een DNA- of eiwit-sequentie in verscheidene databases. Het zoekresultaat laat zien welke gerelateerde sequenties voorkomen in hetzelfde organisme of gerelateerde organismen. Dit geeft in de meeste gevallen een beeld van een functie van een gen waarvan de functie nog onbekend is. BLAST is een tool die veel gebruikt wordt in de bio-informatica.

Verschillende BLAST-programma's

  • blastp: vergelijkt een aminozuursequentie met een aminozuursequentiedatabase
  • blastn: vergelijkt een nucleïnezuursequentie met een nucleïnezuursequentiedatabase.
  • blastx: Vergelijkt een nucleïnezuursequentie met een eiwitsequentiedatabase door de DNA-sequentie op alle open reading frames te vertalen naar een aminozuursequentie.
  • tblastn: vergelijkt een aminozuursequentie met een nucleïnezuursequentiedatabase, die dynamisch getransleerd is in alle open reading frames.
  • tblastx: vergelijkt een in alle frames vertaalde nucleïnezuursequentie met een nucleïnezuursequentiedatabase, die ook vertaald is op alle reading frames.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.