Od sezonu 2003/04 klub nazywał się Krasyliw-Obołoń (główny sponsor browar „Obołoń” posiada zakład w Krasiłowie).
Latem 2004 roku odbyła się fuzja z klubem Podilla Chmielnicki, który występował w Drugiej Lidze, dzięki czemu klub ze stolicy obwodu uzyskał możliwość występować w Pierwszej Lidze. Po fuzji klub z nową nazwą Podilla Chmielnicki występował w Chmielnickim. W sezonie 2006/07 klub ukończył rundę jesienną oraz zagrał dwa mecze rundy wiosennej. Później miejscowa władza odmówiła w finansowaniu klubu tak jak klub był prywatną własnością. Wtedy klub przeniósł się do Krasiłowa, zmienił nazwę na Podilla Krasiłów, ale zajął spadkowe 18. miejsce i został zdegradowany do Drugiej Lihi. Jednak w następnym sezonie do rozgrywek w Drugiej Lidze przystąpił nowo utworzony Podilla-Chmelnyćkyj Chmielnicki. Klub Podilla Krasiłów ponownie przyjął nazwę FK Krasiłów i występuje w rozgrywkach Mistrzostw i Pucharu obwodu chmielnickiego.
