Klub Varaždin ŠN został założony w miejscowości Varaždin1 lipca2012 roku[2]. Tak jak po zakończeniu sezonu 2011/12 NK Varaždin, który istniał pod różnymi nazwami od 1931 roku, z powodu długów 40 milionów kun został zdegradowany do ligi regionalnej, gdzie grał aż do rozwiązania w 2015 roku. W tym samym roku miasto Varaždin utworzyło nowy, wolny od długów klub, który również zaczął grać w lidze regionalnej.
W 2015 roku po rozwiązaniu historycznego klubu, zmienił nazwę na NK Varaždin oraz logo upadłego klubu. W sezonie 2015/16 startował w 3. HNL. W sezonie 2016/17 po zajęciu drugiego miejsca w grupie wschodniej awansował do 2. HNL. W sezonie 2017/18 uzyskał drugą pozycję w drugiej lidze, jednak przegrał w barażach z Istrą 1961. W sezonie 2018/19 zespół wygrał drugą ligę i po raz pierwszy w historii osiągnął najwyższy poziom w Chorwacji.
Barwy klubowe, strój
Niebieski
Biały
Klub ma barwy niebiesko-białe. Zawodnicy domowe spotkania zazwyczaj grają w niebieskich koszulkach, niebieskich spodenkach oraz niebieskich getrach.
Sukcesy
Trofea międzynarodowe
Nie uczestniczył w rozgrywkach europejskich (stan na 31-05-2019).
Trofea krajowe
Zdobyte trofea w rozgrywkach Chorwacji (stan na: 31-05-2019)