IRF4

2DLL

IRF4
Регуляторный фактор интерферона 4
PDB в комплексе с 2dll.PDB в комплексе с 2dll.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

2DLL

Идентификаторы
Символ IRF4 ; LSIRF; MUM1; NF-EM5
Внешние ID OMIM: 601900 MGI: 1096873 HomoloGene: 1842 GeneCards: Ген IRF4
Генная онтология
Функция • regulatory region DNA binding

• sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• protein binding
• transcription factor binding
• protein-lysine N-methyltransferase activity

• sequence-specific DNA binding
Компонент клетки • nuclear nucleosome

• nucleus
• cytosol

• membrane
Биологический процесс • transcription, DNA-templated

• peptidyl-lysine methylation
• cytokine-mediated signaling pathway
• negative regulation of toll-like receptor signaling pathway
• T cell activation
• defense response to protozoan
• myeloid dendritic cell differentiation
• positive regulation of DNA binding
• histone H3 acetylation
• histone H4 acetylation
• positive regulation of interleukin-10 biosynthetic process
• positive regulation of interleukin-2 biosynthetic process
• positive regulation of interleukin-13 biosynthetic process
• positive regulation of interleukin-4 biosynthetic process
• regulation of T-helper cell differentiation
• positive regulation of transcription, DNA-templated
• positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
• interferon-gamma-mediated signaling pathway
• type I interferon signaling pathway

• T-helper 17 cell lineage commitment
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 3662 16364
Ensembl ENSG00000137265 ENSMUSG00000021356
UniProt Q15306 Q64287
RefSeq (мРНК) NM_001195286 NM_013674
RefSeq (белок) NP_001182215 NP_038702
Локус (UCSC) Chr 6:
0.39 – 0.41 Mb		 Chr 13:
30.75 – 30.77 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Регуляторный фактор интерферона 4, также известный как MUM1 — белок, который у человека, кодируется геном IRF4,[1][2][3], расположенным на 6p25-p23.

Символ MUM1 многозначен; он старше синонима для IRF4 (HGNC: 6119), кроме того, нынешний официальный символ HGNC для меланомы связан с (мутированным) антигеном 1 (HGNC: 29641; расположенном в 19p13.3).

Клиническое значение

В пигментных клетках ген IRF4 может регулироваться MITF[англ.].[4] IRF4 является фактором транскрипции, который вовлечен в острый лейкоз.[5] Этот ген сильно ассоциирован с различной пигментацией, как то: чувствительность кожи к воздействию солнца, веснушки, голубой цвет глаз, и коричневый цвет волос.[6]

Взаимодействия

IRF4, как было выявлено, взаимодействует с:

См. также

Примечания

  1. ↑ Grossman A., Mittrücker H.W., Nicholl J., Suzuki A., Chung S., Antonio L., Suggs S., Sutherland G.R., Siderovski D.P., Mak T.W. Cloning of human lymphocyte-specific interferon regulatory factor (hLSIRF/hIRF4) and mapping of the gene to 6p23-p25 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1997. — February (vol. 37, no. 2). — P. 229—233. — doi:10.1006/geno.1996.0547. — PMID 8921401.
  2. ↑ Xu D., Zhao L., Del Valle L., Miklossy J., Zhang L. Interferon regulatory factor 4 is involved in Epstein-Barr virus-mediated transformation of human B lymphocytes (англ.) // J Virol[англ.] : journal. — 2008. — June (vol. 82, no. 13). — P. 6251—6258. — doi:10.1128/JVI.00163-08. — PMID 18417578. — PMC 2447047.
  3. ↑ Entrez Gene: IRF4 interferon regulatory factor 4.
  4. ↑ Hoek K.S., Schlegel N.C., Eichhoff O.M., Widmer D.S., Praetorius C., Einarsson S.O., Valgeirsdottir S., Bergsteinsdottir K., Schepsky A., Dummer R., Steingrimsson E. Novel MITF targets identified using a two-step DNA microarray strategy (англ.) // Pigment Cell Melanoma Res.[англ.] : journal. — 2008. — Vol. 21, no. 6. — P. 665—676. — doi:10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x. — PMID 19067971.
  5. ↑ Adamaki M., Lambrou G.I., Athanasiadou A., Tzanoudaki M., Vlahopoulos S., Moschovi M. Implication of IRF4 aberrant gene expression in the acute leukemias of childhood (англ.) // PLOS One : journal. — 2013. — Vol. 8, no. 8. — P. e72326. — doi:10.1371/journal.pone.0072326. — PMID 23977280. — PMC 3744475.
  6. ↑ Praetorius C., Grill C., Stacey S.N., Metcalf A.M., Gorkin D.U., Robinson K.C., Van Otterloo E., Kim R.S., Bergsteinsdottir K., Ogmundsdottir M.H., Magnusdottir E., Mishra P.J., Davis S.R., Guo T., Zaidi M.R., Helgason A.S., Sigurdsson M.I., Meltzer P.S., Merlino G., Petit V., Larue L., Loftus S.K., Adams D.R., Sobhiafshar U., Emre N.C., Pavan W.J., Cornell R., Smith A.G., McCallion A.S., Fisher D.E., Stefansson K., Sturm R.A., Steingrimsson E. A Polymorphism in IRF4 Affects Human Pigmentation through a Tyrosinase-Dependent MITF/TFAP2A Pathway (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2013. — November (vol. 155, no. 5). — P. 1022—1033. — doi:10.1016/j.cell.2013.10.022. — PMID 24267888.
  7. ↑ 1 2 Gupta S., Jiang M., Anthony A., Pernis A.B. Lineage-specific modulation of interleukin 4 signaling by interferon regulatory factor 4 (англ.) // Journal of Experimental Medicine[англ.] : journal. — Rockefeller University Press[англ.], 1999. — December (vol. 190, no. 12). — P. 1837—1848. — doi:10.1084/jem.190.12.1837. — PMID 10601358. — PMC 2195723.
  8. ↑ Rengarajan J., Mowen K.A., McBride K.D., Smith E.D., Singh H., Glimcher L.H. Interferon regulatory factor 4 (IRF4) interacts with NFATc2 to modulate interleukin 4 gene expression (англ.) // Journal of Experimental Medicine[англ.] : journal. — Rockefeller University Press[англ.], 2002. — April (vol. 195, no. 8). — P. 1003—1012. — doi:10.1084/jem.20011128. — PMID 11956291. — PMC 2193700.
  9. ↑ Brass A.L., Zhu A.Q., Singh H. Assembly requirements of PU.1-Pip (IRF-4) activator complexes: inhibiting function in vivo using fused dimers (англ.) // EMBO J. : journal. — 1999. — February (vol. 18, no. 4). — P. 977—991. — doi:10.1093/emboj/18.4.977. — PMID 10022840. — PMC 1171190.
  10. ↑ Escalante C.R., Shen L., Escalante M.C., Brass A.L., Edwards T.A., Singh H., Aggarwal A.K. Crystallization and characterization of PU.1/IRF-4/DNA ternary complex (англ.) // J. Struct. Biol.[англ.] : journal. — 2002. — July (vol. 139, no. 1). — P. 55—9. — doi:10.1016/S1047-8477(02)00514-2. — PMID 12372320.

Литература

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.