لعب ليونيل سكالوني خلال مسيرته الاحترافية مع 8 أندية في خمسة وعشرون موسمًا وسجل خلالها 24 هدفًا ضمن 389 مباراة. حيث فاز في موسمين بالكأس وفي موسم واحد بالدوري.
خاض ليونيل سكالوني مسيرته مع FC Barcelona (beach soccer) [الإنجليزية] في موسم 1994–95 ولمدة موسمين، مشاركًا في 12 مباراة ولم يسجل أي هدف. ثم انتقل إلى نادي إستوديانتيس دي لا بلاتا في موسم 1996–97 ولمدة موسمين، حيث شارك في 37 مباراة سجل خلالها 7 أهداف. لينتقل بعدها إلى نادي ديبورتيفو لاكورونيا في موسم 1997–98 ليلعب معه تسعة مواسم، مشاركًا في 202 مباراة سجل خلالها 14 هدفًا. ثم انتقل إلى نادي وست هام يونايتد في موسم 2005–06 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 13 مباراة ولم يسجل أي هدف. هذا وانتقل لاحقًا إلى نادي راسينغ سانتاندير في موسم 2006–07 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 30 مباراة سجل خلالها هدفين. ثم انتقل بعدها إلى نادي ريال مايوركا في موسم 2007–08 ولمدة موسمين، مشاركًا في 28 مباراة ولم يسجل أي هدف. ليعود وينتقل من جديد، لكن هذه المرة إلى نادي لاتسيو في موسم 2009–10 ليلعب معه أربعة مواسم، مشاركًا في 52 مباراة سجل خلالها هدفًا واحدًا. لينتقل بعدها إلى نادي أتالانتا في موسم 2012–13 واستمر معه طيلة ثلاثة مواسم، مشاركًا في 15 مباراة ولم يسجل أي هدف.[6]