Nach Beendigung des Ersten Weltkriegs erfolgte seine Übernahme in die Reichsmarine und die Versetzung auf den Kleinen KreuzerMedusa. Anschließend kam er als Adjutant in den Stab der Marinestation der Ostsee und verblieb unter Beförderung zum Oberleutnant zur See am 1. April 1922 bis zum 24. September 1923 dort. In der Folgezeit wurde Ehrhardt als Wachoffizier auf verschiedenen Torpedobooten verwendet. Man ernannte Ehrhardt am 6. April 1926 zum Flaggleutnant und versetzte ihn zum Stab der Ostseeflotte. Am 27. September 1928 übernahm er sein erstes Kommando mit dem Torpedoboot Falke und in gleicher Funktion vom 16. Februar 1929 bis 26. September 1930 das Torpedoboot Greif. In der Zwischenzeit hatte man ihn am 1. April 1929 zum Kapitänleutnant befördert. Am 27. September 1930 kam er als Flaggleutnant zum Flottenkommando und übernahm am 22. September 1931 als Chef eine Kompanie im II. Bataillon der Schiffsstammdivision Ostsee. Vom 29. September 1933 bis 29. November 1936 wurde Korvettenkapitän (seit 1. April 1935) Ehrhardt als Admiralsstabsoffizier zur Marinestation Ostsee versetzt. Die kommenden zwei Jahre verbrachte Ehrhardt als Navigationsoffizier auf dem PanzerschiffDeutschland und nahm mit dem Schiff unterstützend am Spanischen Bürgerkrieg teil.
Ab 1. November 1938 wechselte er in das Personalamt des Oberkommandos der Marine, wurde am 1. Januar 1939 zum Fregattenkapitän befördert und nach Beginn des Zweiten Weltkriegs am 25. November 1939 zum Abteilungschef ernannt. Als Kapitän zur See (seit 1. April 1940) übertrug man ihm am 1. November 1942 die Leitung des Personalamtes. Vom 31. Januar bis 14. März 1943 wurde er kurzzeitig zur Disposition gestellt und im Anschluss zum Kommandanten des Schweren KreuzersPrinz Eugen ernannt. Nach seiner Ablösung am 4. Januar 1944 erfolgte seine Ernennung zum Kommandeur der Marinekriegsschule Schleswig[1] und die Beförderung zum Konteradmiral am 1. August 1944. Nach der deutschen Gesamtkapitulation verblieb er zunächst im Amt und geriet mit den Resten der Reichsregierung im Sonderbereich Mürwik am 25. Mai 1945 in britischeKriegsgefangenschaft, aus der er am 30. November 1946 entlassen wurde.
Am 16. Juni 1957 trat Ehrhardt als Flottillenadmiral in die neu gegründete Bundesmarine ein und war zunächst im Bundesministerium für Verteidigung tätig. Ehrhardt wurde – unter gleichzeitiger Beförderung zum Konteradmiral – am 1. Juli 1957 zum ersten Kommandeur des Kommandos der Marineausbildung (KdoMarAusb) in Kiel ernannt.
Ehrhardt war verheiratet, sein dritter Sohn Dieter Ehrhardt (1927–2021) avancierte in der Bundesmarine ebenfalls zum Konteradmiral. Werner Ehrhardt liegt auf dem Kieler Nordfriedhof begraben.[2]
Dermot Bradley, Heinz-Peter Würzenthal, Hansgeorg Model: Die Generale und Admirale der Bundeswehr 1955–1997 – Die militärischen Werdegänge (= Dermot Bradley [Hrsg.]: Deutschlands Generale und Admirale. Teil VIb). Band1, Adam – Fuhr. Biblio-Verlag, Osnabrück 1998, ISBN 978-3-7648-2492-1, S.454–455.
Clemens Range: Kriegsgedient – Die Generale und Admirale der Bundeswehr. Translimes Media Verlag, Müllheim-Britzingen 2013, ISBN 978-3-00-043646-8, S.121.
Hans H. Hildebrand und Ernest Henriot: Deutschlands Admirale 1849–1945 Band 1: A–G, Biblio Verlag, Osnabrück 1988, ISBN 3-7648-1499-3, S. 275–276
↑Karl H. Peter: Seeoffizieranwärter. Ihre Ausbildung von 1848 bis heute. Mürwik 1969, Seiten 106 und 167 (Anlage 12) (online auf pkgodzik.de) (PDF; 2,4 MB)
↑Dieter Hartwig: Marinegeschichte auf dem Kieler Nordfriedhof. Ludwig, Kiel 202 (Sonderveröffentlichung der Gesellschaft für Kieler Stadtgeschichte; 97), ISBN 978-3-86935-416-3, S. 89–91.