La trimyristine peut être facilement isolée de la poudre de noix de muscade dans la mesure où l'huile de noix de muscade en contient plus de 80 %, tandis que la masse sèche de noix de muscade en poudre en contient environ 20 à 25 %. La séparation de la trimyristine est généralement réalisée par entraînement à la vapeur tandis que la purification est réalisée à partir de l'extraction par l'éther diéthylique suivie d'une autre distillisation ou d'un traitement par évaporateur rotatif pour en éliminer le solvant volatil. On peut également procéder à l'extraction de la trimyristine par l'éther diéthylique à température ambiante en raison de la grande solubilité de ce composé dans l'éther.