Nella stagione 1968-1969 il Bari disputa il campionato di Serie B, con 47 punti in classifica ottiene la terza posizione che gli vale la promozione in Seria A, con la Lazio prima con 50 punti ed il Brescia secondo con 48 punti.
Il Bari, sempre affidato alle cure di Lauro Toneatto, disputa un campionato d'avanguardia, secondo al termine del girone di andata con 24 punti alle spalle del Brescia capolista, si conferma anche nel girone discendente, ed ammaestrato dalla delusione della stagione passata, con la promozione sfumata nelle ultime battute del torneo, riesce ad avere la meglio nello sprint finale per la terza posizione sulla Reggiana, e a conquistare la promozione. In Coppa Italia i galletti sono inseriti nel Gruppo Quarto, vinto dal Foggia. Con nove reti Marcello Tentorio è stato il miglior realizzatore stagionale del team.