CAP1

CAP1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1K8F

Идентификаторы
ПсевдонимыCAP1, CAP, CAP1-PEN, CAP, adenylate cyclase-associated protein 1 (yeast), adenylate cyclase associated protein 1
Внешние IDOMIM: 617801 MGI: 88262 HomoloGene: 74572 GeneCards: CAP1
Расположение гена (Мышь)
4-я хромосома мыши
Хр.4-я хромосома мыши[1]
4-я хромосома мыши
Расположение в геноме CAP1
Расположение в геноме CAP1
Локус4|4 D2.2Начало122,752,840 bp[1]
Конец122,779,849 bp[1]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
    н/д
Наибольшая экспрессия в
  • lateral septal nucleus

  • dentate gyrus of hippocampal formation granule cell

  • transitional epithelium of urinary bladder

  • tibiofemoral joint

  • decidua
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

10487

12331

Ensembl

ENSG00000131236

ENSMUSG00000028656

UniProt

Q01518
Q5T0R9

P40124

RefSeq (мРНК)

NM_001105530
NM_006367
NM_001330502

NM_001301067
NM_007598
NM_001358035
NM_001358036

RefSeq (белок)
NP_001099000
NP_001317431
NP_006358
NP_001337404
NP_001337405

NP_001337406
NP_001337407
NP_001337408
NP_001337409
NP_001337410
NP_001337411
NP_001337412
NP_001337413
NP_001337414

NP_001287996
NP_031624
NP_001344964
NP_001344965

Локус (UCSC)н/дChr 4: 122.75 – 122.78 Mb
Поиск по PubMedИскать[2]Искать[3]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

CAP1 (англ. Adenylyl cyclase-associated protein 1) — белок, регулирующий динамику актина. Продукт гена CAP1[4][5][6]

Функция

Белок регулирует динамику актиновых филаментов и участвует в ряде комплексных процессов развития и морфологии, включая локализацию мРНК и установление полярности клетки[7]. Белок экспрессирован практически во всех тканях организма[7].

Структура

Ген CAP1 близок по структуре с соответствующим геном CAP из S. cerevisiae, который играет роль в сигнальном пути цАМФ. Белок человека CAP1 взаимодействует с другим CAP1, а также с CAP2 и актином[6]. Белок состоит из 475 аминокислот, молекулярная масса 51,9 кДа. Содержит домен C-CAP (319–453). Альтернативный сплайсинг приводит к образованию 3 изоформ белка.

Взаимодействия

CAP1 взаимодействует с ACTG1[8] и CAP2[5].

Литература

  • Yu G., Swiston J., Young D. Comparison of human CAP and CAP2, homologs of the yeast adenylyl cyclase-associated proteins (англ.) // Journal of Cell Science[англ.] : journal. — The Company of Biologists[англ.], 1994. — Vol. 107, no. 6. — P. 1671—1678. — PMID 7962207.
  • Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
  • Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K. et al. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
  • Moriyama K., Yahara I. Human CAP1 is a key factor in the recycling of cofilin and actin for rapid actin turnover (англ.) // Journal of Cell Science[англ.] : journal. — The Company of Biologists[англ.], 2003. — Vol. 115, no. Pt 8. — P. 1591—1601. — PMID 11950878.
  • Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — Bibcode:2002PNAS...9916899M. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Gevaert K., Goethals M., Martens L. et al. Exploring proteomes and analyzing protein processing by mass spectrometric identification of sorted N-terminal peptides (англ.) // Nature Biotechnology : journal. — Nature Publishing Group, 2004. — Vol. 21, no. 5. — P. 566—569. — doi:10.1038/nbt810. — PMID 12665801.
  • Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
  • Dodatko T., Fedorov A. A., Grynberg M. et al. Crystal structure of the actin binding domain of the cyclase-associated protein (англ.) // Biochemistry : journal. — 2004. — Vol. 43, no. 33. — P. 10628—10641. — doi:10.1021/bi049071r. — PMID 15311924.
  • Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Rual J. F., Venkatesan K., Hao T. et al. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — Bibcode:2005Natur.437.1173R. — PMID 16189514.
  • Fautsch M. P., Vrabel A. M., Johnson D. H. The identification of myocilin-associated proteins in the human trabecular meshwork (англ.) // Exp. Eye Res. : journal. — 2006. — Vol. 82, no. 6. — P. 1046—1052. — doi:10.1016/j.exer.2005.09.016. — PMID 16289162.
  • Oh J. H., Yang J. O., Hahn Y. et al. Transcriptome analysis of human gastric cancer (англ.) // Mamm. Genome[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 12. — P. 942—954. — doi:10.1007/s00335-005-0075-2. — PMID 16341674.
  • Gregory S. G., Barlow K. F., McLay K. E. et al. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 (англ.) // Nature : journal. — 2006. — Vol. 441, no. 7091. — P. 315—321. — doi:10.1038/nature04727. — Bibcode:2006Natur.441..315G. — PMID 16710414.
  • Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D. M., Giorgianni F. Phosphoproteomic analysis of the human pituitary // Pituitary. — 2006. — Т. 9, № 2. — С. 109—120. — doi:10.1007/s11102-006-8916-x. — PMID 16807684.
  • Garewal G., Das R., Awasthi A. et al. The clinical significance of the spectrum of interactions of CAP+1 (A-->C), a silent beta-globin gene mutation, with other beta-thalassemia mutations and globin gene modifiers in north Indians (англ.) // Eur. J. Haematol. : journal. — 2007. — Vol. 79, no. 5. — P. 417—421. — doi:10.1111/j.1600-0609.2007.00958.x. — PMID 17900295.

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028656 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Matviw H., Yu G., Young D. Identification of a human cDNA encoding a protein that is structurally and functionally related to the yeast adenylyl cyclase-associated CAP proteins (англ.) // Mol Cell Biol : journal. — 1992. — November (vol. 12, no. 11). — P. 5033—5040. — PMID 1406678. — PMC 360436.
  5. ↑ 1 2 Hubberstey A., Yu G., Loewith R., Lakusta C., Young D. Mammalian CAP interacts with CAP, CAP2, and actin (англ.) // J Cell Biochem[англ.] : journal. — 1997. — April (vol. 61, no. 3). — P. 459—466. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19960601)61:3<459::AID-JCB13>3.0.CO;2-E. — PMID 8761950.
  6. ↑ 1 2 Entrez Gene: CAP1 CAP, adenylate cyclase-associated protein 1 (yeast).
  7. ↑ 1 2 Kakurina G. V., Kolegova E. S., Kondakova I. V. Adenylyl Cyclase-Associated Protein 1: Structure, Regulation, and Participation in Cellular Processes (англ.) // Biochemistry (Mosc) : journal. — 2018. — Vol. 83, no. 1. — P. 45—53. — doi:10.1134/S0006297918010066. — PMID 29534668.
  8. ↑ Hubberstey, A; Yu G; Loewith R; Lakusta C; Young D. Mammalian CAP interacts with CAP, CAP2, and actin (англ.) // J. Cell. Biochem.[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1996. — June (vol. 61, no. 3). — P. 459—466. — ISSN 0730-2312. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19960601)61:3<459::AID-JCB13>3.0.CO;2-E. — PMID 8761950.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.