Majaelrayo liegt in einer Höhe von ca. 1185 m in der Kulturlandschaft der Serranía. Im Gemeindegebiet liegt der Ocejón mit 2046 m Höhe. Die Entfernung zur südsüdöstlich gelegenen Provinzhauptstadt Guadalajara beträgt ca. 60 Kilometer (Fahrtstrecke). Das Klima ist gemäßigt bis warm; Regen fällt übers Jahr verteilt.