CD93

CD93
Ідентифікатори
Символи	CD93, C1QR1, C1qR(P), C1qRP, CDw93, ECSM3, MXRA4, dJ737E23.1, CD93 molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 120577 MGI: 106664 HomoloGene: 7823 GeneCards: CD93
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • complement component C1q complex binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • carbohydrate binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• cell surface; • мембрана; • клітинна мембрана; • secretory granule membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • specific granule membrane; • tertiary granule membrane; • ficolin-1-rich granule membrane; • integral component of membrane;
Біологічний процес	• Фагоцитоз; • macrophage activation; • адгезія клітин; • GO:0022415 viral process; • neutrophil degranulation; • cell-cell adhesion; • GO:0072468 сигнальна трансдукція;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	22918
	17064
	ENSG00000125810
	ENSMUSG00000027435
	Q9NPY3
	O89103
	NM_012072
	NM_010740
	NP_036204
	NP_034870
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD93 (англ. CD93 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 652 амінокислот, а молекулярна маса — 68 560^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATSMGLLLL	LLLLLTQPGA	GTGADTEAVV	CVGTACYTAH	SGKLSAAEAQ
NHCNQNGGNL	ATVKSKEEAQ	HVQRVLAQLL	RREAALTARM	SKFWIGLQRE
KGKCLDPSLP	LKGFSWVGGG	EDTPYSNWHK	ELRNSCISKR	CVSLLLDLSQ
PLLPSRLPKW	SEGPCGSPGS	PGSNIEGFVC	KFSFKGMCRP	LALGGPGQVT
YTTPFQTTSS	SLEAVPFASA	ANVACGEGDK	DETQSHYFLC	KEKAPDVFDW
GSSGPLCVSP	KYGCNFNNGG	CHQDCFEGGD	GSFLCGCRPG	FRLLDDLVTC
ASRNPCSSSP	CRGGATCVLG	PHGKNYTCRC	PQGYQLDSSQ	LDCVDVDECQ
DSPCAQECVN	TPGGFRCECW	VGYEPGGPGE	GACQDVDECA	LGRSPCAQGC
TNTDGSFHCS	CEEGYVLAGE	DGTQCQDVDE	CVGPGGPLCD	SLCFNTQGSF
HCGCLPGWVL	APNGVSCTMG	PVSLGPPSGP	PDEEDKGEKE	GSTVPRAATA
SPTRGPEGTP	KATPTTSRPS	LSSDAPITSA	PLKMLAPSGS	PGVWREPSIH
HATAASGPQE	PAGGDSSVAT	QNNDGTDGQK	LLLFYILGTV	VAILLLLALA
LGLLVYRKRR	AKREEKKEKK	PQNAADSYSW	VPERAESRAM	ENQYSPTPGT
DC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у мембрані.

Література

Nepomuceno R.R., Henschen-Edman A.H., Burgess W.H., Tenner A.J. (1997). cDNA cloning and primary structure analysis of C1qR(P), the human C1q/MBL/SPA receptor that mediates enhanced phagocytosis in vitro. Immunity. 6: 119—129. PMID 9047234 DOI:10.1016/S1074-7613(00)80419-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
McGreal E.P., Ikewaki N., Akatsu H., Morgan B.P., Gasque P. (2002). Human C1qRp is identical with CD93 and the mNI-11 antigen but does not bind C1q. J. Immunol. 168: 5222—5232. PMID 11994479 DOI:10.4049/jimmunol.168.10.5222
Kittlesen D.J., Chianese-Bullock K.A., Yao Z.Q., Braciale T.J., Hahn Y.S. (2000). Interaction between complement receptor gC1qR and hepatitis C virus core protein inhibits T-lymphocyte proliferation. J. Clin. Invest. 106: 1239—1249. PMID 11086025 DOI:10.1172/JCI10323
Nepomuceno R.R., Ruiz S., Park M., Tenner A.J. (1999). C1qRP is a heavily O-glycosylated cell surface protein involved in the regulation of phagocytic activity. J. Immunol. 162: 3583—3589. PMID 10092817

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15855 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NPY3 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15855 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9NPY3 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]