ITGA6

ITGA6
Ідентифікатори
Символи	ITGA6, CD49f, ITGA6B, VLA-6, integrin subunit alpha 6, JEB6
Зовнішні ІД	OMIM: 147556 MGI: 96605 HomoloGene: 20091 GeneCards: ITGA6
Пов'язані генетичні захворювання
	рак простати
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • integrin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • laminin binding; • neuregulin binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • insulin-like growth factor I binding; • cadherin binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • focal adhesion; • basal part of cell; • клітинна мембрана; • hemidesmosome; • базальна мембрана; • cell surface; • integrin complex; • basal plasma membrane; • basolateral plasma membrane; • external side of plasma membrane; • integrin alpha6-beta4 complex; • Філоподія;
Біологічний процес	• cellular response to extracellular stimulus; • hemidesmosome assembly; • renal system development; • nail development; • positive regulation of cell-cell adhesion; • filopodium assembly; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; • extracellular matrix organization; • odontogenesis of dentin-containing tooth; • cell-substrate adhesion; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • адгезія клітин; • cell adhesion mediated by integrin; • brown fat cell differentiation; • positive regulation of apoptotic process; • cell-substrate junction assembly; • integrin-mediated signaling pathway; • positive regulation of phosphorylation; • cell-matrix adhesion; • digestive tract development; • ectodermal cell differentiation; • leukocyte migration; • skin development; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • amelogenesis; • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound; • positive regulation of cell-substrate adhesion; • positive regulation of cell migration; • cell-cell adhesion; • positive regulation of neuron projection development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3655
	16403
	ENSG00000091409
	ENSMUSG00000027111
	P23229
	Q61739
NM_000210; NM_001079818; NM_001316306; NM_001365529; NM_001365530;
	NM_001394928
	NM_001277970; NM_008397
	NP_000201; NP_001073286; NP_001303235; NP_001352458; NP_001352459
	NP_001264899; NP_032423; NP_001393187
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITGA6 (англ. Integrin subunit alpha 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 130 амінокислот, а молекулярна маса — 126 606^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAGQLCLL	YLSAGLLSRL	GAAFNLDTRE	DNVIRKYGDP	GSLFGFSLAM
HWQLQPEDKR	LLLVGAPRAE	ALPLQRANRT	GGLYSCDITA	RGPCTRIEFD
NDADPTSESK	EDQWMGVTVQ	SQGPGGKVVT	CAHRYEKRQH	VNTKQESRDI
FGRCYVLSQN	LRIEDDMDGG	DWSFCDGRLR	GHEKFGSCQQ	GVAATFTKDF
HYIVFGAPGT	YNWKGIVRVE	QKNNTFFDMN	IFEDGPYEVG	GETEHDESLV
PVPANSYLGL	LFLTSVSYTD	PDQFVYKTRP	PREQPDTFPD	VMMNSYLGFS
LDSGKGIVSK	DEITFVSGAP	RANHSGAVVL	LKRDMKSAHL	LPEHIFDGEG
LASSFGYDVA	VVDLNKDGWQ	DIVIGAPQYF	DRDGEVGGAV	YVYMNQQGRW
NNVKPIRLNG	TKDSMFGIAV	KNIGDINQDG	YPDIAVGAPY	DDLGKVFIYH
GSANGINTKP	TQVLKGISPY	FGYSIAGNMD	LDRNSYPDVA	VGSLSDSVTI
FRSRPVINIQ	KTITVTPNRI	DLRQKTACGA	PSGICLQVKS	CFEYTANPAG
YNPSISIVGT	LEAEKERRKS	GLSSRVQFRN	QGSEPKYTQE	LTLKRQKQKV
CMEETLWLQD	NIRDKLRPIP	ITASVEIQEP	SSRRRVNSLP	EVLPILNSDE
PKTAHIDVHF	LKEGCGDDNV	CNSNLKLEYK	FCTREGNQDK	FSYLPIQKGV
PELVLKDQKD	IALEITVTNS	PSNPRNPTKD	GDDAHEAKLI	ATFPDTLTYS
AYRELRAFPE	KQLSCVANQN	GSQADCELGN	PFKRNSNVTF	YLVLSTTEVT
FDTPDLDINL	KLETTSNQDN	LAPITAKAKV	VIELLLSVSG	VAKPSQVYFG
GTVVGEQAMK	SEDEVGSLIE	YEFRVINLGK	PLTNLGTATL	NIQWPKEISN
GKWLLYLVKV	ESKGLEKVTC	EPQKEINSLN	LTESHNSRKK	REITEKQIDD
NRKFSLFAER	KYQTLNCSVN	VNCVNIRCPL	RGLDSKASLI	LRSRLWNSTF
LEEYSKLNYL	DILMRAFIDV	TAAAENIRLP	NAGTQVRVTV	FPSKTVAQYS
GVPWWIILVA	ILAGILMLAL	LVFILWKCGF	FKRSRYDDSV	PRYHAVRIRK
EEREIKDEKY	IDNLEKKQWI	TKWNENESYS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hogervorst F., Kuikman I., Geurts van Kessel A., Sonnenberg A. (1991). Molecular cloning of the human alpha 6 integrin subunit. Alternative splicing of alpha 6 mRNA and chromosomal localization of the alpha 6 and beta 4 genes. Eur. J. Biochem. 199: 425—433. PMID 2070796 DOI:10.1111/j.1432-1033.1991.tb16140.x
Tamura R.N., Cooper H.M., Collo G., Quaranta V. (1991). Cell type-specific integrin variants with alternative alpha chain cytoplasmic domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10183—10187. PMID 1946438 DOI:10.1073/pnas.88.22.10183
Catimel B., Parmentier S., Leung L.L., McGregor J.L. (1991). Separation of important new platelet glycoproteins (GPIa, GPIc, GPIc*, GPIIa and GMP-140) by F.P.L.C. Characterization by monoclonal antibodies and gas-phase sequencing. Biochem. J. 279: 419—425. PMID 1953640 DOI:10.1042/bj2790419
Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200
Pawar S.C., Demetriou M.C., Nagle R.B., Bowden G.T., Cress A.E. (2007). Integrin alpha6 cleavage: a novel modification to modulate cell migration. Exp. Cell Res. 313: 1080—1089. PMID 17303120 DOI:10.1016/j.yexcr.2007.01.006

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ITGA6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6142 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P23229 (англ.) . Архів оригіналу за 12 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ITGA6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6142 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P23229 (англ.) . Архів оригіналу за 12 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]